Les Perses attaquent la cité fortifiée d'Alamut parce qu'un espion y aurait découvert des ateliers de fabrication d'armes destinées aux ennemis de la Perse. Dastan, le fis adoptif du roi de Perse, est le héros de la bataille. Lors d'un corps à corps, il s'empare d'une dague. Son frère aîné, Tus, héritier du trône, le persuade d'offrir au roi un vêtement qui se révèle être empoisonné. Le roi meurt. Dastan, accusé et pourchassé, fuit avec la princesse Tamina d'Alamut. Il découvre que la dague est un objet sacré qui permet de remonter le temps. Dastan et Tamina sont recueillis par des brigands du désert. Mais Dastan est reconnu. Il s'échappe et se rend secrètement aux funérailles de son père. Il réalise que son oncle Nizam est à l'origine du meurtre du roi et qu'il travaille avec une armée secrète, les Hassansins. Lorsque Tus, devenu roi, demande un procès équitable pour Dastan, Nizam décide de supprimer ce dernier. Dastan et Tamina veulent empêcher Nizam de briser le sablier du temps, qui pourrait alors détruire leur monde. Arrivés au sanctuaire de la dague, ils sont attaqués par les Perses et Garsiv, un autre frère de Dastan, meurt. Ils retournent à Alamut. Tamina se sacrifie pour que Dastan puisse sauver le monde. Les sables du temps se répandent, Dastan revient au moment où il a obtenu la dague. Il confond Nizam. Les Perses s'excusent d'avoir attaqué Alamut et Dastan est offert en mariage à Tamina, qui accepte.