D'un côté, il y a Carmen et Juni, qui trouvent leurs parents un tantinet ringards et ne rêvent que d'espionnage et de piment dans une vie banale et choyée. De l'autre, il y a Floop, la star télé de tous les enfants (et surtout de Juni) qui est en fait un agent d'une terrible organisation secrète qui veut conquérir le monde. Et puis, il y a aussi les parents de Carmen et Juni : Ingrid et Gregorio, qui étaient deux super agents secrets très célèbres, aujourd'hui rangés des voitures. Dans la petite famille Cortez, voilà que la vie va être bouleversée. Brusquement leur maison est assaillie de toutes parts par des mains géantes. Les parents sont faits prisonniers. Mais Carmen et Juni ne sont pas au bout de leurs surprises quand ils découvrent que leur maison est piégée, truffée de passages secrets qui débouchent dans un sous-marin de poche. Pris en chasse, ils parviennent à trouver refuge sur une île d'où ils entreprennent de libérer leurs parents. C'est que Floop veut s'emparer d'un cerveau artificiel miniature conçu jadis par Gregorio afin de maîtriser une armée de clones d'enfants. Parvenus au château de Floop, les deux enfants, affrontant les mains-soldats et les enfants-clones, détruisent le cerveau miniature et libèrent leurs parents. Floop, pas si méchant les aidera à s'enfuir. La vie semble plus drôle, depuis, pour Carmen et Juni !