Après de dramatiques incidents à Londres et Berlin, un envoyé britannique se rend au Kenya pour essayer de convaincre Allan Quatermain de venir à Londres prendre la tête d'une "Ligue de gentlemen extraordinaires". Après une sauvage agression, il accepte. Il rencontre le fameux "M", chef des services secrets, qui lui annonce que tout cela est l'oeuvre du Fantôme, dont le but est de fomenter la guerre mondiale, afin de vendre ses armes sophistiquées. "M" lui présente une partie de ses compagnons : le capitaine Nemo, savant indien, le cambrioleur invisible Rodney Skinner, et la jolie Mina Harker, qui se révélera être un vampire. Ils vont chercher l'immortel Dorian Gray. Là, ils sont attaqués par des agents du Fantôme, mais ils sont sauvés grâce à l'intervention du jeune Tom Sawyer, agent secret américain. ì Paris, ils enrôlent le Dr. Jekyll et son terrifiant double, Mr Hyde. Le projet du Fantôme est de profiter d'une réunion des chefs d'�0tat à Venise pour les faire sauter. Ils se rendent donc tous sur la lagune, à bord du superbe "Nautilus" du capitaine Nemo. Ils arrivent à sauver Venise, découvrent que "M" n'est autre que l'abominable Dr. Moriarty, et que Dorian Gray les a trahis. Ils les poursuivent jusque dans leur usine secrète, qu'ils détruisent. Mais Moriarty tue Quatermain avant d'être abattu par Sawyer.