Un couple est mort dans sa maison. Dans la cave, on trouve le corps d'une femme inconnue, désignée comme « Jane Doe ». Tommy Tilden, médecin légiste, enseigne le métier à son fils Austin dans la morgue installée au sous-sol de leur maison. Austin a rendez-vous avec sa petite amie Emma, mais le shérif amène le corps de Jane et demande une autopsie sur le champ. Austin reste pour aider son père et promet à Emma de la rejoindre vers 23h. L'examen commence. Le corps présente des signes anormaux. Un tissu manuscrit était dans ses organes. Des phénomènes étranges se produisent, et les deux hommes pensent être traqués par les autres cadavres de la morgue. Ils décident de brûler Jane, mais le corps absorbe les flammes. Tous deux sont poursuivis, et Tommy porte un coup de hache à l'aveugle sur l'un des cadavres. Il a en réalité tué Emma, venue chercher Austin. Pour en finir, ils décident de trouver la cause de la mort de Jane. Des cellules de son cerveau vivent encore. Le tissu révèle qu'elle serait une innocente à laquelle on a fait subir un rituel infligé aux sorcières du XVIIe siècle. Une énergie vit donc toujours en Jane, qui inflige son supplice à Tommy. Austin achève son père, à l'agonie. Le matin, Austin entend le shérif. Il part le trouver et entend la voix de son père. Il se retourne et voit son cadavre. En sursautant, il fait une chute mortelle. La police envoie le corps de Jane Doe, redevenu intact, dans une autre morgue...