Elisa se rend, comme chaque matin, à la base militaire où elle fait le ménage. Son handicap (elle est muette), la coupant un peu du monde, elle se réfugie dans un univers de comédie musicale avec son voisin solitaire, Giles. Mais un jour, elle assiste à l'étrange spectacle de l'arrivée d'un large caisson, qui contient apparemment une créature. Puis elle voit le colonel Strickland, chargé de surveiller la bête, surgir de la salle où est entreposé le caisson, deux doigts arrachés par cette dernière. Elisa retrouve les doigts, qui sont vite recousus à son propriétaire. Puis elle commence à entrer en contact avec la créature et s'attache fortement à elle, en lui donnant des oeufs et en lui passant de la musique. Mais Strickland, qui torture régulièrement son prisonnier, incite ses supérieurs à opter pour une dissection pure et simple. Elisa trouve un allié inattendu en la personne d'un espion russe caché dans la base. Avec son soutien et l'aide de ses amis, elle fait s'échapper la créature et la cache chez elle. Ils entament alors une vraie relation amoureuse. Mais les choses se compliquent car la créature manque d'eau et commence à dépérir. Un jour, elle griffe Giles et ce dernier connaît alors une sorte de rajeunissement progressif. Rendu ivre de rage et de douleur par le pourrissement de son doigt, Strickland remue ciel et terre pour retrouver la créature. Il finit par la retrouver, et les deux amants s'enfuient. La créature tue finalement Strickland, et emporte Elisa avec lui dans les eaux, vers son monde.