Années 1980. Encore fillette, Jean Grey provoque, faute de maîtriser ses pouvoirs télékinésiques et télépathiques, un accident qui coûte la vie à ses parents. Le professeur Xavier la recueille dans son école pour mutants. 1992. Une équipe d'X-Men - Mystique, Fauve, Cyclope, Vif-argent et Jean - secourt l'équipage d'une navette spatiale. Mais dans l'opération, Jean est traversée par une force cosmique, à laquelle elle survit par miracle. Jean constate que ses pouvoirs ont été décuplés, et découvre que Xavier lui a menti : son père est vivant. Elle se rend chez lui, mais celui-ci la rejette. Xavier et les X-Men l'y retrouvent, mais, ne contrôlant plus ses pouvoirs, elle tue Mystique, avant de prendre la fuite. Elle se réfugie dans la communauté de mutants qu'a fondée Magneto, et où des militaires s'efforcent en vain de l'appréhender. Magneto l'enjoint à quitter les lieux. Décidé à venger Mystique, Fauve va trouver Magneto, cependant que des créatures extraterrestres, guidées par Lilandra, pistent Jean, dont elles convoitent le pouvoir. Magneto, Fauve et Tornade s'en prennent à Jean. Xavier et Cyclope s'interposent, pendant que Lilandra tente de s'accaparer son pouvoir. Les mutants sont interpellés, puis convoyés, par train, vers un centre de rétention. Lilandra et les siens donnent l'assaut. Magneto et Fauve font front commun avec Xavier, lequel libère Jean, qui triomphe de Lilandra en se sacrifiant. Plus tard. Fauve a pris la tête de l'école. Xavier et Magneto se retrouvent à la terrasse d'un café.