1835. Dans une île proche des Galapagos, Ed et sa sœur, l’intrépide Op, sont deux Bouchetrous - de petites créatures à fourrure avec un trou au milieu du corps - qui peinent à se faire accepter de leurs semblables. Accidentellement aspirés par une fleur magique, ils sont propulsés à Shanghaï, de nos jours. Un petit chien, Clarance, leur explique que, deux siècles plus tôt, leur espèce s’est éteinte à cause de l’éruption du volcan de l’île. Il les conduit dans le “terminal temporel”, d’où l’on peut, en passant d’une fleur à l’autre, explorer différents lieux et époques. C’est lors d’un de ces voyages que son maître, le docteur Chung, disparut... Mais une maladresse d’Ed et Op envoie Clarance en pleine expédition polaire. Ed et Op font la connaissance des “extinctibles”, derniers représentants d’espèces éteintes sauvés par le docteur Chung : Dottie la dodo, Burnie le tigre de Tasmanie, Alma la meridiungulata et Hoss le tricératops. Avec leur aide, Ed et Op ramènent Clarance. Mais Ed reproche à Op d’avoir agi, une fois encore, de façon irréfléchie. Blessée, Op part seule retrouver les Bouchetrous pour les prévenir de l’éruption. Mais Clarance la rejoint, équipé d’une bombe à retardement. C’est lui qui, autrefois, jaloux des Bouchetrous, provoqua leur extinction - et se débarrassa de son maître. Ed et les extinctibles volent au secours de Op. Ed et Op affrontent Clarance et, avant que la bombe explose, parviennent à téléporter l’île deux siècles plus tard. Le monde découvre les Bouchetrous.