Tim, qui a grandi, est désormais marié à Carol, et père du bébé Tina et de Tabitha, 10 ans, qui accepte de moins en moins ses marques d’affection. Il retrouve Wizzie, jouet magicien, qui se remet à marcher. Ted découvre que Tina est désormais une recrue de l’entreprise Baby Corp. Elle appelle Ted à la rescousse et les envoie, Tim et lui, à Baby Corp. Ils découvrent qu’ils devront déjouer les plans du professeur Armstrong, qui sape l’enfance et n’est autre que le directeur de l’école de Tabitha. Pour la mission, Tim redevient un enfant, Ted un bébé, et ils doivent se cacher de la famille de Tim. Le lendemain, ils se rendent à l’école pour y espionner Armstrong. Tim, sous le nom de Marcos, sympathise avec Tabitha. Pendant ce temps, Ted réussit à s’échapper de la crèche et rencontre Armstrong, impressionné par ses dons, qui lui révèle qu’il est lui-même un bébé et lui donne rendez-vous le soir. Ted découvre qu’Armstrong développe en secret des applications de bébés à succès et compte prendre le pouvoir grâce à l’une d’elles. Marcos aide Tabitha à avoir davantage confiance en elle pour le spectacle du lendemain. Ted, Tim et Tina mettent au point un plan pour contrer Armstrong, mais ce dernier capture les deux frères, alors que sa nouvelle application lobotomise les parents qui prennent en photo leurs enfants. Avec l’aide de Tabitha, Tina libère les deux frères ; ensemble ils parviennent à accéder aux serveurs d’Armstrong et à faire planter l’application. Toute la famille est réunie.