2012. Un groupe de djihadistes, ayant pris le contrôle de Tombouctou, impose aux habitants sa conception radicale de la charia : la musique, le football et la cigarette sont prohibés et les tenues vestimentaires, soumises à des règles drastiques. Kidane et Satima, un couple de bergers touaregs, vivent à l'écart de la ville, dans le désert, avec leur jeune fille, Toya. Inquiets de la situation, ils se refusent pourtant à fuir. Abdelkrim, l'un des leaders djihadistes, vient parfois trouver Satima qui, de toute évidence, lui plaît. Peu à peu, les exactions des fondamentalistes - qui imposent des règles absurdes et procèdent à des mariages forcés - se multiplient. L'imam tente, en vain, de les raisonner. Seule Zabou, folle de toute évidence, brave leur autorité. Un jour que le jeune Issan emmène le troupeau de Kidane se désaltérer, l'une de ses vaches se prend dans les filets d'un pécheur, Amadou, qui, aussitôt, la tue.Furieux, Kidane, muni d'un pistolet, va trouver Amadou. Ils se battent et, accidentellement, Amadou est tué. Kidane ne tarde pas à être arrêté par les djihadistes. Pour s'être risquée à chanter, une jeune femme est condamnée à être fouettée en place publique. Un couple "illégitime" est lapidé. Victime d'un procès expéditif, Kidane est condamné à mort. Un motocycliste conduit Satima à la ville, où elle se précipite vers Kidane, sur le point d'être exécuté. Tous deux sont abattus par les djihadistes, qui se lancent à la poursuite du motocycliste.