Tim est un heureux garçon de 7 ans, jusqu'au jour où arrive son petit-frère, un bébé accoutré d'un costume noir et d'un attaché-case ! Jaloux, Tim découvre qu'il n'est pas un bébé comme les autres : parlant comme un quinquagénaire, Baby Boss est ici pour accomplir la mission de Baby Corp, l'organisation qui veille sur l'amour des parents pour les bébés... L'amour des parents pour les chiots au détriment des enfants progressant de plus en plus, Baby Boss doit empêcher la découverte d'un nouveau chiot. En cas d'échec, il devra rester à jamais dans la famille et deviendra un bébé normal... En effet, avec Baby Corp, les bébés boivent un lait qui leur permet de rester bébé. En cas de réussite, Baby Boss sera promu PDG. Ils se rendent à Puppy Co., l'entreprise où travaillent les parents de Tim, et découvrent qu'un ancien PDG de Baby Corp, Francis E. Francis, a créé, pour se venger de celle-ci, un chiot qui serait éternel grâce au lait de Baby Boss. Il vole le lait, fait garder Tim et Baby Boss par son acolyte Eugène, et emmène les parents de Tim pour le grand salon de Puppy Co. à Las Vegas, où sera présenté le chiot. Tim et Baby Boss s'échappent. Arrivés au salon, ils empêchent le lancement des chiots. Baby Boss est promu PDG, et Tim est de nouveau seul à la maison, ses parents ayant tout oublié. Tim envoie une lettre à Baby Boss pour qu'il revienne. Il repasse la sélection de Baby Corp et revient comme un bébé normal.