Tarascon, France, 1956. Dans une église, un prêtre est brûlé vif par un démon. Quelque temps plus tard. Une femme voit Maurice - homme à tout faire au pensionnat pour jeunes filles de Sainte-Marie - se comporter étrangement : le démon Valak / La Nonne la tue. Dans un couvent roumain, Sœur Irene reçoit la visite d’un prélat : plusieurs religieux ayant été affreusement assassinés, il lui demande d’enquêter. Accompagnée de Sœur Debra, elle part pour Tarascon. Elle y découvre que Maurice se trouvait sur les lieux du drame. Elle comprend qu’il est possédé : Valak se déplace avec lui. La directrice du pensionnat est tuée par Valak. Sœur Irene et Sœur Debra découvrent que le démon en a après les yeux de Sainte Lucie, relique cachée à Sainte-Marie. Maurice s’y trouve avec l’institutrice, Kate, et la fille de celle-ci, Sophie, lorsque Sœur Irene et Sœur Debra arrivent. Possédé par Valak, Maurice s’en prend à Irene. Sœur Debra l’assomme. Les Sœurs, Sophie et Kate trouvent la relique. Un bouc démoniaque - le diable en personne - s’en prend aux autres élèves. Maurice agresse Sœur Irène ; Sophie fuit avec la relique, poursuivie par Maurice, pendant que Sœur Debra s’efforce de protéger les élèves. Sophie donne la relique à Sœur Irène. Maurice s’en empare. Devenu tout-puissant, Valak essaie de brûler vive Sœur Irene, qui invoque le souvenir de sa mère et lui échappe. En priant, Sœur Irene et Sœur Debra changent le vin du pensionnat en sang du Christ, vainquent Valak et libèrent Maurice.