Le poumon, zone d'échange entre l'air ambiant et le sang, permet la pénétration de l'oxygène nécessaire à l'organisme et l'expulsion du gaz carbonique. Une fois inhalé, l'air atteint les alvéoles pulmonaires. Le revêtement ciliaire de la trachée et des bronches arrête mécaniquement les particules, germes et bactéries et les expulse par le mouvement ciliaire. Certaines particules englobées dans le mucus bronchique sont expulsées lors de la toux. Dans les alvéoles, la seconde ligne de défense pulmonaire entre en action. Des cellules macrophages alvéolaires ont la fonction de phagocyter les bactéries ou de mobiliser des anticorps. Les bactéries en surnombre les font faire appel à des polynucléaires. Une défense locale faible face à des germes en nombre provoque la pneumonie. L'appel doit être fait à un médicament anti-infectieux, antibiotique rapide et de concentration suffisante. Les légionelles virulentes inhibent la fonction de phagosome et de lysosome, le macrophage devient siège de prolifération bactérienne. La septicémie résulte de l'extension de l'infection par voie sanguine, l'insuffisance respiratoire aiguë, par voie aérienne. La pneumopathie infectieuse est imputable au pneumocoque.