Paris, 2013. Les cités ghettos sont d'impitoyables zones de non-droit, coupées du monde extérieur par un mur d'isolement et en proie à une guerre des gangs incessante. Dans la Banlieue 13, Leïto tente de préserver son quartier de l'influence de Taha, chef du plus puissant gang local. Mais Taha fait envoyer Leïto en prison et s'offre sa sœur Lola comme prise de guerre. Six mois plus tard, Damien, membre d'une unité spéciale d'intervention de la police, est chargé par le gouvernement d'une mission à haut risque : infiltrer la Banlieue 13 pour y récupérer une bombe à neutrons tombée aux mains du gang de Taha. Contre son gré, on lui adjoint Leïto comme partenaire. Ce dernier devine que Damien est flic et veut l'abandonner. Les deux hommes sympathisent et se livrent à Taha pour négocier la bombe. Au dernier moment, le gouvernement refuse de payer. Taha apprend que le gouvernement a gelé ses comptes bancaires. Ruiné, il ne peut plus payer ses hommes, qui se retournent contre lui et l'exécutent. K2 est promu chef du gang et accepte de laisser Damien faire son travail. Leïto comprend que Damien est chargé, malgré lui, d'activer la bombe. Avec l'aide de sa sœur, il empêche la catastrophe de se produire. Damien et Leïto font avouer le ministre de l'intérieur, filmé à son insu. Les murs d'isolement sont abattus, et la loi revient dans les banlieues.