Alors qu'il rentrait tranquillement au port, le sous-marin Neptune est éperonné par un immense cargo norvégien qui file sans demander son reste. Sous le choc, le sous-marin coule et s'écrase sur un récif à plusieurs centaines de mètres de profondeur. Tandis qu'une partie de l'équipage, sous la direction de l'efficace commandant Blanchard, répare au mieux les dégâts multiples, l'alerte est donnée au quartier général. En pleine nuit, Bennett est prévenu que la « Lady grise » a coulé. Le dispositif de sécurité habituel est aussitôt mis en place. Mais un éboulement empêche le D.S.R.V. de recueillir comme prévu les naufragés par le panneau de secours. Bennett fait alors appel au capitaine Gâtes et au prototype que ce dernier expérimente, le « Snark ». Cet engin révolutionnaire permet de localiser l'épave et de dégager au plus vite le panneau de secours. Mais, à la suite d'un glissement, le sous-marin se trouve déséquilibré. L'héroïque sacrifice de deux marins ne permet pas le redressement total du Neptune : en désespoir de cause, les autorités décident de placer un explosif sous le rocher qui bloque le sous-marin. Le D.S.R.V. peut entreprendre l'évacuation des hommes. Blanchard, le dernier, quitte le Neptune, menacé par l'irruption des eaux ; Gâtes, lui, meurt en prévenant un nouvel éboulement.