Cinq années se sont écoulées depuis le départ des héros de Cocoon vers la planète Antaria, qui ne connaît ni la maladie ni la mort. Mais les cocons immergés au large de la Floride sont menacés par des secousses sismiques. Ils accompagnent donc une équipe composée de Kitty et deux autres extra-terrestres chargée de vérifier leur état. Ben et Mary Luckett retrouvent avec joie leur petit-fils Daniel. Les six interviennent à temps pour empêcher le vieux Bernie, veuf inconsolable et hypocondriaque, de se suicider, puis tentent de le distraire en lui présentant Ruby, une veuve impétueuse. Leur forme physique leur permet de réaliser des exploits comme de battre des jeunes gens au basket, Kitty retrouve avec joie Jack Bonner dont le bateau permet à l'équipe de s'approcher des cocons. L'un d'eux a malheureusement été repêché par un navire de l'Institut d'études océaniques de Saint-Petersbourg et doit être récupéré. Les scientifiques l'ayant ouvert, ils ont découvert l'extra-terrestre. Une océanologue, Sara, se prend de sympathie pour l'Antarien qui s'affaiblit et doit être rapidement secouru. Pendant ce temps, Bess tombe enceinte et Joe Finley est de nouveau atteint de leucémie. En voulant sauver un enfant, sa femme est renversée par une voiture et Joe se sacrifie en lui transmettant son influx vital. Kitty et ses amis réussissent à enlever l'Antarien de l'Institut. Ils repartent, mais Ben et Mary décident de rester pour voir grandir leur petit-fils. Et, comme l'avait prévu Kitty, Jack rencontre la belle Sara, déçue par la recherche.