L'équipe américaine de karaté se rend sur l'île de Triana pour participer aux championnats du monde. De mystérieuses personnes suivent de près l'arrivée de Sean Davidson, le leader de l'équipe ; il est le cobaye parfait pour faire la démonstration au général Andréas, terroriste international, de l'efficacité d'une nouvelle arme bactériologique. Encore faut-il le capturer ! Alors qu'il se promène dans les rues de la ville, Sean croit apercevoir son maître, Izumo, entraîné de force par quelques individus. Une course-poursuite s'ensuit, ponctuée de nombreux combats contre des ninjas, mais en vain. Mis au courant, deux autres membres de l'équipe, Dexter et Curtis, décident d'aider leur leader dans ses recherches. A chaque instant, les karatékas trouvent sur leur route les mystérieux ninjas vêtus de noir. La piste les entraîne jusqu'aux laboratoires Cobra, l'une des fiertés scientifiques du pays. La police, prévenue par Sean, se montre réticente à ouvrir une enquête. A l'intérieur du laboratoire, le patron confie au général Andreas que son plan marche à merveille : depuis le faux Izumo jusqu'aux ninjas noirs qui ont complaisamment mis Sean sur la piste de Cobra, ce n'est plus qu'une question d'heures pour que le champion se jette dans la « gueule du loup » et remplisse son rôle de cobaye. De fait, laissant ses amis à l'extérieur, Sean pénètre dans l'enceinte en vol à voile. Sa visite nocturne lui permet de découvrir une fantastique école de ninjas avant d'être fait prisonnier. La nouvelle arme bactériologique va pouvoir enfin être testée ; le traitement débute mais alors que Sean commence à en ressentir les effets, une jeune fille, aperçue dans l'école de ninjas, le libère. Réussissant à quitter le laboratoire-forteresse, Sean et sa compagne rejoignent leurs amis. A eux quatre, ils mettent fin aux activités malfaisantes de la bande.