Au large des cotes d'Irlande, Joe et Sam, deux pêcheurs pacifiques, sont vivement inquiétés par des explosions et remous sous-marins qui leur paraissent suspects. A la suite d'une plongée, un de leurs compagnons meurt, terrassé par une vision d'épouvante. Ils décident de gagner la petite île de Nara, où ils sont reçus assez mal par un certain Mac Cartis qui fait fortune dans la recherche de trésors sous-marins. Mais ces trésors sont gardés jalousement par Gorgo, le monstre des profondeurs, que les explosions de Mac Cartis dérange et qui vient parfois la nuit se venger sur les habitants de l'île. Joe et Sam décident de s'attaguer à Gorgo et, après une capture mouvementée, le traînent dans un filet jusqu'en Angleterre où il est vendu très cher au directeur du zoo, dont la fortune est faite ainsi. Toute l'Angleterre, en procession, défile devant le monstre enchaîné et crachant le feu qui, d'un coup de patte, écroule un immeuble et d'un coup de queue peut tuer trois éléphants. Mais Gorgo est malheureux loin de son élément et son seul ami, le petit Jean, n'ose plus le délivrer devant les dégâts qu'il peut causer. C'est alors que du fond des mers, un énorme remous menace toutes les îles Britanniques. La mère de Gorgo se dresse de ses 100 mètres de haut pour remonter toute la Tamise, malgré tous les feux croisés de l'Amirauté et, dans un écroulement apocalyptique, récupère son petit Gorgo et retourne majestueusement avec lui dans les mystères des profondeurs.