Un satellite américain s'échoue en Australie, sa précieuse boîte noire est engloutie par un crocodile. La CIA envoie deux agents, Wheeler et Archer, pour la retrouver. Steve Irwin et sa femme Terri, aventuriers, sillonnent l'Australie pour sauver les animaux féroces. Ils les étudient pour leur zoo, et leurs périlleuses aventures passent sur la chaîne Discovery. Non loin de la rivière où a élu domicile le crocodile, vit une fermière qui voit son bétail régulièrement dévoré par la bête. Devant son désir obsédant d'éliminer le reptile, les services de l'environnement vont faire appel aux Irwin pour débusquer le crocodile, et le conduire loin des hommes. Sur les traces de la balise, les deux agents sont "aidés" par Jo, engagée par la NRO pour les devancer. Les Irwin parviennent à capturer le crocodile. Suivant leur radar, la CIA pense alors que la balise a été volée par le couple, des espions sûrement. Devenant violents, Wheeler et Archer, suivis de Jo, les pourchassent. Les Irwin, qui pensent avoir affaire à des braconniers, parviennent à les immobiliser après avoir relâché le crocodile. Ils retrouvent la balise dans les excréments du crocodile et s'apprêtent à jeter cet objet métallique polluant, lorsqu'ils sont encerclés par l'armée. Celle-ci, ayant élucidé l'affaire, leur envoie Wheeler et Archer comme main-d'oeuvre au zoo.