Ingénieur américain, Bill Markham vit avec sa femme et ses deux enfants en Amazonie où il participe à la construction d'un barrage. Au cours d'une promenade, Tommy, âgé de 7 ans, disparaît. Dix ans plus tard, les Markham sont toujours dans la région. Et Bill, qui n'a pas cessé de rechercher Tommy, connaît parfaitement tout ce qui se rapporte aux Indiens. C'est pourquoi un photographe, Werner, vient un jour le pousser à une nouvelle expédition. Enlevé par les « Invisibles », Tommy, appelé maintenant Tomme, partage totalement la culture et la civilisation des Indiens. Après avoir été initié par le chef Wanadi, il a même été fiancé à la jeune Kachiri. Alors qu'il recherche les pierres magiques qui permettent aux « Invisibles » de réaliser leurs peintures tribales, Tomme se trouve brutalement face à face avec un homme qui lui rappelle quelque chose. C'est Bill, blessé, poursuivi par les « Féroces », ennemis des « Invisibles ». Tomme ramène son père au village où on le soigne. Une fois guéri Bill, qui respecte les choix de Tomme, revient seul vers le monde civilisé. Pour anéantir les « Invisibles », les « Féroces » ont négocié à des proxénètes l'échange de quelques filles contre des munitions pour le fusil-mitrailleur qu'ils ont trouvé. Le camp des « Invisibles » est dévasté et les femmes, prostituées. Pour les délivrer, Tomme se rend en ville et fait appel à son père. Celui-ci monte une opération de commando qui réussit. Bill estime alors que pour protéger les « Invisibles » et son fils des méfaits de la civilisation, il faut détruire le barrage. Mais c'est la pluie diluvienne que les « Invisibles » ont appelée par leurs incantations qui finit par en venir à bout.